ノボジーン
  • ノボジーン
  • ゲノミクス
    • ヒト全ゲノムシーケンス
    • 動植物全ゲノムシーケンス
    • 微生物全ゲノムシーケンス
    • 動植物de novoシーケンス
    • 微生物de novoシーケンス
    • ショットガンメタゲノムシーケンス
    • アンプリコンシーケンス
    • 全エクソームシーケンス
    トランスクリプトミクス
    • mRNAシーケンス
    • トータルRNAシーケンス
    • 全長トランスクリプトームシーケンス
    • 全トランスクリプトームシーケンス
    • スモールRNAシーケンシング
    • 環状RNAシーケンス
    • メタトランスクリプトームシーケンス
    • 原核生物RNAシーケンス
    シングルセルと空間オミクス
    • シングルセル遺伝子発現解析
    • シングルセル免疫プロファイリングシーケンス
    • シングルセルロングリードトランスクリプトーム
    エピゲノミクス
    • 全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)
    • ディレクトDNAメチレーションシーケンス(DM-Seq)new
    • 還元型バイサルファイトシーケンス (RRBS)
    • クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)
    • RNA免疫沈降シーケンス (RIP-Seq)

    相乗りシーケンス

    • 相乗りシーケンス(イルミナプラットフォーム)
    • 相乗りシーケンス(PacBioプラットフォーム)
    プロテオミクス & メタボロミクス
    • Olinkプロテオミクス
  • プロモーションプロモーション
    • プラットフォーム
    • インテリジェント自動化プラットフォーム(Falcon)
    • バイオインフォマティクス解析ツール(NovoMagic)
    • カスタマサービスシステム(CSS)
    • パンフレット
    • ケーススタディ
    • ウェビナー
    • ブログ
    • サンプルガイドライン
    • コンミュニティ
    • がん研究
    • がん免疫
    • アグリゲノミクス
    • 環境
    • 食品科学
    • ヒトマイクロバイオーム
    • 植物および動物マイクロバイオーム
    • 創薬および開発
    • 希少および複雑性疾患
    • ノボジーンについて
    • 拠点一覧
    • ニュース
    • キャリア
  • お問い合わせお問い合わせ

サービスサービス menu

サポートサポート menu

会社会社 menu

サービス
全ゲノムシーケンスde novoシーケンスアンプリコンシーケンスショットガンメタゲノムシーケンスディレクトDNAメチレーションシーケンス(DM-Seq)mRNAシーケンスシングルセル遺伝子発現解析Olinkプロテオミクス
サポート
バイオインフォマティクス解析ツール(NovoMagic)カスタマサービスシステム(CSS)インテリジェント自動化プラットフォーム(Falcon)
会社
ノボジーンについて拠点一覧プラットフォームニュースキャリアお問い合わせ
YouTubeYouTube hoverXX hover
Copyright © 2026 Novogene Inc. All rights reserved. 本サービスは研究目的のみにご利用ください。臨床診断目的には使用頂けません。
ノボジーン
  • ノボジーン
  • ゲノミクス
    • ヒト全ゲノムシーケンス
    • 動植物全ゲノムシーケンス
    • 微生物全ゲノムシーケンス
    • 動植物de novoシーケンス
    • 微生物de novoシーケンス
    • ショットガンメタゲノムシーケンス
    • アンプリコンシーケンス
    • 全エクソームシーケンス
    トランスクリプトミクス
    • mRNAシーケンス
    • トータルRNAシーケンス
    • 全長トランスクリプトームシーケンス
    • 全トランスクリプトームシーケンス
    • スモールRNAシーケンシング
    • 環状RNAシーケンス
    • メタトランスクリプトームシーケンス
    • 原核生物RNAシーケンス
    シングルセルと空間オミクス
    • シングルセル遺伝子発現解析
    • シングルセル免疫プロファイリングシーケンス
    • シングルセルロングリードトランスクリプトーム
    エピゲノミクス
    • 全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)
    • ディレクトDNAメチレーションシーケンス(DM-Seq)new
    • 還元型バイサルファイトシーケンス (RRBS)
    • クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)
    • RNA免疫沈降シーケンス (RIP-Seq)

    相乗りシーケンス

    • 相乗りシーケンス(イルミナプラットフォーム)
    • 相乗りシーケンス(PacBioプラットフォーム)
    プロテオミクス & メタボロミクス
    • Olinkプロテオミクス
  • プロモーションプロモーション
    • プラットフォーム
    • インテリジェント自動化プラットフォーム(Falcon)
    • バイオインフォマティクス解析ツール(NovoMagic)
    • カスタマサービスシステム(CSS)
    • パンフレット
    • ケーススタディ
    • ウェビナー
    • ブログ
    • サンプルガイドライン
    • コンミュニティ
    • がん研究
    • がん免疫
    • アグリゲノミクス
    • 環境
    • 食品科学
    • ヒトマイクロバイオーム
    • 植物および動物マイクロバイオーム
    • 創薬および開発
    • 希少および複雑性疾患
    • ノボジーンについて
    • 拠点一覧
    • ニュース
    • キャリア
  • お問い合わせお問い合わせ

サービスサービス menu

サポートサポート menu

会社会社 menu

サービス
全ゲノムシーケンスde novoシーケンスアンプリコンシーケンスショットガンメタゲノムシーケンスディレクトDNAメチレーションシーケンス(DM-Seq)mRNAシーケンスシングルセル遺伝子発現解析Olinkプロテオミクス
サポート
バイオインフォマティクス解析ツール(NovoMagic)カスタマサービスシステム(CSS)インテリジェント自動化プラットフォーム(Falcon)
会社
ノボジーンについて拠点一覧プラットフォームニュースキャリアお問い合わせ
YouTubeYouTube hoverXX hover
Copyright © 2026 Novogene Inc. All rights reserved. 本サービスは研究目的のみにご利用ください。臨床診断目的には使用頂けません。
banner laptop bg
banner mobile bg

スモールRNAシーケンス

スモールRNA種を包括的にプロファイリングし、制御性RNAポピュレーションと転写後遺伝子制御メカニズムを明らかにします。
ご相談ください
(スモールRNAシーケンス)
ご相談ください
(スモールRNAシーケンス)
概要概要
利点利点
アプリケーションアプリケーション
仕様仕様
リソースリソース

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、miRNA、siRNA、piRNAなどの制御RNAを含むスモールRNAを同定、定量、特性評価するハイスループット次世代シーケンス(NGS)手法です。既知のスモールRNAの検出と新規スモールRNA種の発見を可能にし、遺伝子制御、発生、ストレス応答、疾患生物学における役割への知見を明らかにします。

ノボジーンのスモールRNA-seqサービスは、多様なスモールRNAポピュレーションを1回のアッセイで高感度・高解像度にプロファイリングします。ロバストな自社バイオインフォマティクスパイプラインにより、正確な変動発現解析、新規スモールRNAの発見、構造・配列変化の評価、条件間のmiRNA発現パターンの包括的な特性評価を実現します。

ノボジーンのスモールRNAシーケンスの利点

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、基礎研究と臨床応用に有用な知見を提供することで詳細なスモールRNAの調査を可能にする、先進的NGSテクノロジーです。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

ノボジーンのスモールRNAシーケンスの利点

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、基礎研究と臨床応用に有用な知見を提供することで詳細なスモールRNAの調査を可能にする、先進的NGSテクノロジーです。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

スモールRNAシーケンスのアプリケーション

スモールRNA-seqは、以下を含む優れた研究の機会と臨床的可能性を切り開いています:

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

スモールRNAシーケンスのアプリケーション

スモールRNA-seqは、以下を含む優れた研究の機会と臨床的可能性を切り開いています:

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

仕様

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

仕様

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

解析例

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

解析例

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

その他のサービス

トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)

その他のサービス

トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
Background
Background

プロジェクトを開始する準備はできていますか?

当社のプラットフォームは、ソリューションを提供し、

プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせた シームレスな体験を実現します。

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
プライバシーポリシーCookieポリシーキャリア
banner laptop bg
banner mobile bg

スモールRNAシーケンス

スモールRNA種を包括的にプロファイリングし、制御性RNAポピュレーションと転写後遺伝子制御メカニズムを明らかにします。
ご相談ください
(スモールRNAシーケンス)
ご相談ください
(スモールRNAシーケンス)
概要概要
利点利点
アプリケーションアプリケーション
仕様仕様
リソースリソース

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、miRNA、siRNA、piRNAなどの制御RNAを含むスモールRNAを同定、定量、特性評価するハイスループット次世代シーケンス(NGS)手法です。既知のスモールRNAの検出と新規スモールRNA種の発見を可能にし、遺伝子制御、発生、ストレス応答、疾患生物学における役割への知見を明らかにします。

ノボジーンのスモールRNA-seqサービスは、多様なスモールRNAポピュレーションを1回のアッセイで高感度・高解像度にプロファイリングします。ロバストな自社バイオインフォマティクスパイプラインにより、正確な変動発現解析、新規スモールRNAの発見、構造・配列変化の評価、条件間のmiRNA発現パターンの包括的な特性評価を実現します。

ノボジーンのスモールRNAシーケンスの利点

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、基礎研究と臨床応用に有用な知見を提供することで詳細なスモールRNAの調査を可能にする、先進的NGSテクノロジーです。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

ノボジーンのスモールRNAシーケンスの利点

スモールRNAシーケンス(sRNA-seq)は、基礎研究と臨床応用に有用な知見を提供することで詳細なスモールRNAの調査を可能にする、先進的NGSテクノロジーです。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

2種類のサンプルタイプに対応
2種類のサンプルタイプに対応

トータルRNAおよびエクソソームRNAサンプル由来のスモールRNAシーケンスに対応し、細胞内外環境におけるスモールRNA動態を多面的に探索できます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

新規分子の発見
新規分子の発見

未知のスモールRNA種を同定し、生物学的プロセスにおけるその同一性と機能的役割の理解を広げます。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

疾患関連解析
疾患関連解析

がん、神経性疾患、その他の疾患に関連する異常なスモールRNA発現パターンを明らかにし、バイオマーカー探索と治療ターゲット同定をサポートします。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

制御メカニズムの解明
制御メカニズムの解明

スモールRNAを介した転写後遺伝子制御ネットワークを解明し、細胞内分子相互作用を包括的に把握します。

スモールRNAシーケンスのアプリケーション

スモールRNA-seqは、以下を含む優れた研究の機会と臨床的可能性を切り開いています:

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

スモールRNAシーケンスのアプリケーション

スモールRNA-seqは、以下を含む優れた研究の機会と臨床的可能性を切り開いています:

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

精密プロファイリング

既知のスモールRNA(例:miRNA、siRNA)を定量し、新規スモールRNA分子を発見します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

疾患バイオマーカーの発見

がん、代謝性疾患、感染症の診断・予後バイオマーカーを同定します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

制御メカニズムの解明

スモールRNAが介在する転写後遺伝子制御パスウェイを解明します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

治療ターゲットの探索

創薬および個別化医療に向けてスモールRNAターゲットを予測・検証します。

仕様

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

仕様

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

サンプル要件

サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。 カスタマイズされたご要望についての詳細は、 お問い合わせください

ライブラリタイプサンプルタイプサンプル量RIN (Agilent 5400)純度 (NanoDrop)
Small RNA LibraryTotal RNA≥ 1.5 μg≥6.5, with flat baselineOD260/280≥ 2.0;
OD260/230≥ 2.0;
no degradation, no contamination
Exosomal Small RNA LibraryExosomal RNA≥ 20 ngFragments between
25-200nt, FU>10

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

シーケンスおよび解析

表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望の詳細については、 お問い合わせください 。

シーケンス
プラットフォーム
イルミナNovaSeq
プラットフォーム
Read LengthSingle-end 50 bp
Recommended Sequencing Depth≥ 10 million read pair per sample
Standard Analysis (miRNA)Data Quality Control
Summary of Length Distribution
Common & Specific Sequence Summary
Identification & Characterization of miRNAs
Classification & Annotation of miRNA
Quantification & Differential Expression Analysis
Functional Enrichment Analysis

プロジェクトワークフロー

スモールRNA-seqのワークフローは、サンプル調製とQCから始まります。


total RNAをRNAサンプル調製の出発物として使用します。スモールRNAの3′末端と5′末端にそれぞれ3′および5′アダプターをライゲーションし、逆転写プライマーとのハイブリダイゼーション後に第一鎖cDNAを合成します。PCRエンリッチにより二本鎖cDNAライブラリを作製し、Illuminaシーケンスプラットフォームでシーケンスを行います。下流のプロセスは確立されたバイオインフォマティクスパイプラインに従い、カスタマイズ解析もご要望に応じて提供します。

プロジェクトワークフロー

解析例

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

解析例

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

Image
Image
1/1
総スモールRNAの長さ分布

スモールRNA分子は通常18-40ヌクレオチド(nt)です。長さ分布の確認は、スモールRNAポピュレーションの構成評価と各クラスの相対量の把握に役立ちます。

Image
Image
1/1
反復配列アラインメント

スモールRNAを予測反復配列にアラインメントし、反復領域由来のリードを除外します。続いて反復由来スモールRNAの分布と保持されたスモールRNA総数の統計を作成します。

Image
Image
1/1
miRNA TPM分布

TPMに基づく密度分布はサンプル間のmiRNA発現パターンを示します。横軸はサンプル名、縦軸は各miRNAのlog10(TPM + 1)値です。

Image
Image
1/1
変動発現miRNAのクラスター解析

クラスター解析では類似した発現プロファイルを持つmiRNAをグループ化し、異なる実験条件間で共通する発現パターンを同定します。

Image
Image
1/1
ターゲット遺伝子候補の散布図

このプロットは、予測miRNAターゲット遺伝子に関連するエンリッチGene Ontology(GO)タームを可視化します。x-軸はGOターム、y-軸は統計的有意性を示します。

その他のサービス

トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)

その他のサービス

トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
トータルRNAシーケンス
(トータルRNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
環状RNAシーケンス
(環状RNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
mRNAシーケンス
(mRNAシーケンス)
Background
Background

プロジェクトを開始する準備はできていますか?

当社のプラットフォームは、ソリューションを提供し、

プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせた シームレスな体験を実現します。

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
プライバシーポリシーCookieポリシーキャリア