クロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq、ChIPシーケンス）は、タンパク質-DNA相互作用をゲノムワイドに解析するための堅牢で高解像度な手法です。ヒストン修飾を受けたDNA領域、転写因子、その他のDNA結合タンパク質の結合部位を高精度にマッピングできます。本手法では、内在性のタンパク質-DNA複合体を選択的に分離するクロマチン免疫沈降法（ChIP）のターゲット特異的な濃縮能と、次世代シーケンス（NGS）のハイスループット解析能を組み合わせ、捕えたDNA断片をゲノムスケールで包括的に解析します。
タンパク質-DNA複合体は生細胞から回収されるため、ChIP-seqでは異なる細胞種・組織間、または異なる条件下での結合部位を比較できます。そのため、遺伝子制御およびエピジェネティックな機構の研究に不可欠なツールです。RNA-seqやATAC-seqなどの手法と組み合わせることで、さまざまな生物学的プロセスにおけるマルチオミクスの理解をさらに深めることができます。
業界をリードする納期
超微量断片化DNA（通常の要件を下回る）5 ngまでに対応した豊富な実績
数百件のChIP-seqプロジェクトを成功裏に完了
専門のバイオインフォマティクス解析では、業界標準のMACS2ソフトウェアをはじめとする最新版のプログラムを用い、モチーフ予測、ピークアノテーション、機能解析、データ可視化を実施します。
ChIP-seqと遺伝子発現の相関を検討するための関連解析も提供します。
ChIP-seqは遺伝子制御研究に関するソリューションを提供し、以下のようなカスタマイズされた研究ニーズに対応します。
ゲノムワイドな結合部位のプロファイリングとモチーフ解析により、転写因子による遺伝子制御を解明
実験処理またはサンプル条件に関連するヒストン修飾パターンを把握
統合解析により、エピジェネティックプロファイルと転写制御の関係を調査
サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件 をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、お問い合わせください。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください。
ノボジーンのChIP-seqサービスは、サンプル調製、DNAライブラリ調製、Illumina PE150シーケンス、バイオインフォマティクスパイプラインによるデータ解析の4段階で構成されています。DNAサンプリングからデータレポートの取得に至るまで、各工程はデータ出力量と品質に影響し、その後のバイオインフォマティクス解析結果にも直接影響します。ノボジーンでは、サンプルQC、ライブラリQC、シーケンスデータQCを含むすべての工程を厳格に管理し、高品質・高精度・高信頼性のシーケンスデータと包括的なバイオインフォマティクス解析を提供します。
横軸は染色体上のピークの位置、縦軸は染色体を表しています。それぞれ青いバーは、ピークを示しています。
モチーフ解析結果ファイルには、新規に同定されたモチーフと既知モチーフの結果が含まれます。
各比較群について、変動ピーク領域におけるFold ChangeとFDRの全体分布をボルケーノプロットで表示します。
当社のプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
クロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq、ChIPシーケンス）は、タンパク質-DNA相互作用をゲノムワイドに解析するための堅牢で高解像度な手法です。ヒストン修飾を受けたDNA領域、転写因子、その他のDNA結合タンパク質の結合部位を高精度にマッピングできます。本手法では、内在性のタンパク質-DNA複合体を選択的に分離するクロマチン免疫沈降法（ChIP）のターゲット特異的な濃縮能と、次世代シーケンス（NGS）のハイスループット解析能を組み合わせ、捕えたDNA断片をゲノムスケールで包括的に解析します。
タンパク質-DNA複合体は生細胞から回収されるため、ChIP-seqでは異なる細胞種・組織間、または異なる条件下での結合部位を比較できます。そのため、遺伝子制御およびエピジェネティックな機構の研究に不可欠なツールです。RNA-seqやATAC-seqなどの手法と組み合わせることで、さまざまな生物学的プロセスにおけるマルチオミクスの理解をさらに深めることができます。
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ChIP-seqと遺伝子発現の相関を検討するための関連解析も提供します。
ChIP-seqは遺伝子制御研究に関するソリューションを提供し、以下のようなカスタマイズされた研究ニーズに対応します。
ゲノムワイドな結合部位のプロファイリングとモチーフ解析により、転写因子による遺伝子制御を解明
実験処理またはサンプル条件に関連するヒストン修飾パターンを把握
統合解析により、エピジェネティックプロファイルと転写制御の関係を調査
サンプル量は参考値です。詳細については、サンプル要件 をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、お問い合わせください。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください。
ノボジーンのChIP-seqサービスは、サンプル調製、DNAライブラリ調製、Illumina PE150シーケンス、バイオインフォマティクスパイプラインによるデータ解析の4段階で構成されています。DNAサンプリングからデータレポートの取得に至るまで、各工程はデータ出力量と品質に影響し、その後のバイオインフォマティクス解析結果にも直接影響します。ノボジーンでは、サンプルQC、ライブラリQC、シーケンスデータQCを含むすべての工程を厳格に管理し、高品質・高精度・高信頼性のシーケンスデータと包括的なバイオインフォマティクス解析を提供します。
横軸は染色体上のピークの位置、縦軸は染色体を表しています。それぞれ青いバーは、ピークを示しています。
モチーフ解析結果ファイルには、新規に同定されたモチーフと既知モチーフの結果が含まれます。
各比較群について、変動ピーク領域におけるFold ChangeとFDRの全体分布をボルケーノプロットで表示します。
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