mRNAシーケンス（RNA-Seq）は、高解像度の転写動態を捉える強力なツールです。選択的スプライシング事象の同定、新規遺伝子の発見、変異の特定から遺伝子発現パターンのプロファイリングに至るまで、機能ゲノミクス、疾患メカニズム研究、バイオマーカー発見などの分野において、研究を推進するために不可欠な正確なデータを提供します。
ノボジーンは、完全に統合されたエンドツーエンドのRNA-Seqソリューションを提供します。ノボジーンのワークフローは、RNA抽出、ライブラリ調製からシーケンス、包括的なバイオインフォマティクス解析に至る全プロセスを網羅しています。業界最大級のシーケンス処理能力と厳格なステップごとの品質管理に支えられ、最先端のイルミナNovaSeqプラットフォームを活用することで、信頼性の高い高品質データを迅速なタイムラインで提供します。ノボジーンのNovoMagicクラウドシステムにより、このデータから実用的な生物学的知見をさらに導き出すことが可能になります。これにより単一プラットフォーム内で結果を容易に可視化、カスタマイズ、再解析できます。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
いつでもどこでも迅速な自己主導型解析・可視化を実現
いつでもどこでも迅速な自己主導型解析・可視化を実現
各エリアのテクニカルチームとラボが個別対応・迅速なサービスを提供
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複雑なサンプルや挑戦的な研究に特化したプロジェクト設計
複雑なサンプルや挑戦的な研究に特化したプロジェクト設計
サンプル受領後最短2週間でデータ納品
サンプル受領後最短2週間でデータ納品
ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
いつでもどこでも迅速な自己主導型解析・可視化を実現
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各エリアのテクニカルチームとラボが個別対応・迅速なサービスを提供
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複雑なサンプルや挑戦的な研究に特化したプロジェクト設計
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サンプル受領後最短2週間でデータ納品
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ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
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多様な研究目標を支援するために設計されたノボジーンのサービスで、mRNA-seqの力を発見してください。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
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新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
多様な研究目標を支援するために設計されたノボジーンのサービスで、mRNA-seqの力を発見してください。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
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新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
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新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
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病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
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記載されているサンプル量はあくまで目安です。詳細については、サンプル要件 をダウンロードしてご確認ください。具体的なご要望や詳細につきましては、 弊社までお問い合わせください。
| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
表示されている推奨データ出力および分析内容は、あくまで参考情報です。詳細につきましては、ご要望に合わせて個別にご案内いたしますので、 弊社までお問い合わせください。
| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
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|---|---|
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|---|---|---|---|---|---|---|
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| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
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| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
表示されている推奨データ出力および分析内容は、あくまで参考情報です。詳細につきましては、ご要望に合わせて個別にご案内いたしますので、 弊社までお問い合わせください。
| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
表示されている推奨データ出力および分析内容は、あくまで参考情報です。詳細につきましては、ご要望に合わせて個別にご案内いたしますので、 弊社までお問い合わせください。
| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
理想的なデータ量は、具体的な研究目標によって異なります。以下に、2つの一般的なシナリオに対する全般的なガイドラインを示します：
•標準的な変動発現解析の場合：サンプルあたり2,000万リード（生物学的レプリケート数≥3）で十分な場合が多い。
•低発現遺伝子検出（詳細プロファイリング）の場合：サンプルあたり3,000～6,000万リードが推奨され、少なくとも3,000万リードから開始し、十分なレプリケートを含めること。
当社のプラットフォームは、
お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、プロジェクトの設計からデータの納品に至るまで、シームレスな体験をお約束します。
mRNAシーケンス（RNA-Seq）は、高解像度の転写動態を捉える強力なツールです。選択的スプライシング事象の同定、新規遺伝子の発見、変異の特定から遺伝子発現パターンのプロファイリングに至るまで、機能ゲノミクス、疾患メカニズム研究、バイオマーカー発見などの分野において、研究を推進するために不可欠な正確なデータを提供します。
ノボジーンは、完全に統合されたエンドツーエンドのRNA-Seqソリューションを提供します。ノボジーンのワークフローは、RNA抽出、ライブラリ調製からシーケンス、包括的なバイオインフォマティクス解析に至る全プロセスを網羅しています。業界最大級のシーケンス処理能力と厳格なステップごとの品質管理に支えられ、最先端のイルミナNovaSeqプラットフォームを活用することで、信頼性の高い高品質データを迅速なタイムラインで提供します。ノボジーンのNovoMagicクラウドシステムにより、このデータから実用的な生物学的知見をさらに導き出すことが可能になります。これにより単一プラットフォーム内で結果を容易に可視化、カスタマイズ、再解析できます。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
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各エリアのテクニカルチームとラボが個別対応・迅速なサービスを提供
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複雑なサンプルや挑戦的な研究に特化したプロジェクト設計
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サンプル受領後最短2週間でデータ納品
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ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
年間100万件以上のRNA-seqサンプルを、信頼性の高い洗練されたワークフローで処理。
いつでもどこでも迅速な自己主導型解析・可視化を実現
いつでもどこでも迅速な自己主導型解析・可視化を実現
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複雑なサンプルや挑戦的な研究に特化したプロジェクト設計
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ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
ノボジーンのデータはメーカー性能基準を一貫して上回ります。
多様な研究目標を支援するために設計されたノボジーンのサービスで、mRNA-seqの力を発見してください。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
多様な研究目標を支援するために設計されたノボジーンのサービスで、mRNA-seqの力を発見してください。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
異なる組織、状態、治療における転写プロファイルを理解する。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
新規転写産物、選択的スプライシング、変異を特定し包括的な視点を得る。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
経時的な遺伝子発現を通じて発達メカニズムと薬剤耐性を研究する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
新規転写産物、SNP/InDel同定、融合遺伝子発見を用いて潜在的なバイオマーカーを発見する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
トランスクリプトームデータとオミクス的アプローチを統合し、全体像を把握する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
病原性メカニズムと臨床サブタイプを調査し、精密な臨床診断を実現する。
記載されているサンプル量はあくまで目安です。詳細については、サンプル要件 をダウンロードしてご確認ください。具体的なご要望や詳細につきましては、 弊社までお問い合わせください。
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|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
記載されているサンプル量はあくまで目安です。詳細については、サンプル要件 をダウンロードしてご確認ください。具体的なご要望や詳細につきましては、 弊社までお問い合わせください。
| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
表示されている推奨データ出力および分析内容は、あくまで参考情報です。詳細につきましては、ご要望に合わせて個別にご案内いたしますので、 弊社までお問い合わせください。
| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
ノボジーンのmRNA-Seqワークフローは、厳格な段階的なプロセスにより高品質な結果を保証します：
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
| mRNA-seq analysis without reference genome •Data quality control •De novo transcriptome assembly •Gene functional annotation •CDS prediction •SSR analysis •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis |
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
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|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
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| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
| Strand-specific Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline |
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| サービス | サンプルタイプ | サンプル量 (Qubit®) | 液量 | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Eukaryotic mRNA (PolyA enrichment) | Total RNA (Animal/Plant/Fungus) | ≥ 200 ng | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 4.0, with flat baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 20 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 5.0, with flat baseline | ||
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| シーケンス プラットフォーム | イルミナ NovaSeq プラットフォーム |
|---|---|
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|---|---|
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| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
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|---|---|
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|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Recommended Data Amount | • ≥ 20 million read pairs per sample for species with reference genome • ≥ 50 million read pairs per sample for species without reference genome (de novo transcriptome assembly projects) |
| Data Analysis Capability | mRNA-seq analysis with reference genome •Data quality control •Gene expression quantification •Differential expression profiling •Functional enrichment analysis •Novel gene prediction •SNP & InDel analysis •Alternative splicing (AS) analysis •Fusion gene prediction •Protein-Protein Interaction (PPI) analysis •Oncogene functional annotation |
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サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
サンプル間の相関をヒートマップで可視化。
有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
異なるサンプル群におけるDEGsの発現プロファイルをクラスタリング。
KEGGデータベースに基づく、DEGs間でエンリッチされた生物学的パスウェイ。
同一クラスター内の遺伝子は、処理条件全体で協調的な発現変化を示す。
rMATSソフトウェアにより同定された変動選択的スプライシング事象。
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有意に発現上昇・下降した遺伝子のボルケーノプロット。
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理想的なデータ量は、具体的な研究目標によって異なります。以下に、2つの一般的なシナリオに対する全般的なガイドラインを示します：
•標準的な変動発現解析の場合：サンプルあたり2,000万リード（生物学的レプリケート数≥3）で十分な場合が多い。
•低発現遺伝子検出（詳細プロファイリング）の場合：サンプルあたり3,000～6,000万リードが推奨され、少なくとも3,000万リードから開始し、十分なレプリケートを含めること。
当社のプラットフォームは、
お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、プロジェクトの設計からデータの納品に至るまで、シームレスな体験をお約束します。
