シングルセルRNAシーケンス（scRNA-seq）は、バルクRNA-seqでは完全に隠されてしまう細胞間の差異や細胞内不均一性の検出を可能にします。個々の細胞レベルでの遺伝子発現に関する高解像度の知見を提供します。生物学や医学の幅広い分野で応用されるシングルセルシーケンスは、細胞の挙動、機能、調節に関する他に類を見ない理解をもたらします。
10x Genomics® Chromium™XテクノロジーとIllumina® NovaSeq™ X Plusプラットフォームを基盤に、ノボジーンはサンプル処理・ライブラリ調製からシーケンス・バイオインフォマティクス解析までを網羅するエンドツーエンドのシングルセルRNAシーケンス（scRNA-seq）ソリューションを提供します。深い技術的専門性と顧客中心のアプローチで提供されるノボジーンのソリューションは、シングルセルレベルでのトランスクリプトーム解析と免疫プロファイリングの高解像度探索を可能にします。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
シングルセルRNA-Seqは、以下のような幅広い研究分野をサポートする強力なツールです：
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
シングルセルRNA-Seqは、以下のような幅広い研究分野をサポートする強力なツールです：
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
当社のプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
シングルセルRNAシーケンス（scRNA-seq）は、バルクRNA-seqでは完全に隠されてしまう細胞間の差異や細胞内不均一性の検出を可能にします。個々の細胞レベルでの遺伝子発現に関する高解像度の知見を提供します。生物学や医学の幅広い分野で応用されるシングルセルシーケンスは、細胞の挙動、機能、調節に関する他に類を見ない理解をもたらします。
10x Genomics® Chromium™XテクノロジーとIllumina® NovaSeq™ X Plusプラットフォームを基盤に、ノボジーンはサンプル処理・ライブラリ調製からシーケンス・バイオインフォマティクス解析までを網羅するエンドツーエンドのシングルセルRNAシーケンス（scRNA-seq）ソリューションを提供します。深い技術的専門性と顧客中心のアプローチで提供されるノボジーンのソリューションは、シングルセルレベルでのトランスクリプトーム解析と免疫プロファイリングの高解像度探索を可能にします。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
サンプル処理・QC、ライブラリ調製、シーケンス、バイオインフォマティクス解析までをカバーするシームレスなシングルセルRNA-seqソリューションは、論文掲載可能な図表を提供し、研究を加速します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
神経組織や脂肪組織など困難なサンプルタイプの豊富な経験に裏打ちされた、業界トップクラスの納期で高品質な結果を提供します。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
核抽出や凍結組織向け専用パイプラインなど多様なテクノロジーにより、要求の厳しいscRNA-seqプロジェクトでも高品質な遺伝子発現データを保証。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
10x GenomicsおよびIllumina認定サービスプロバイダーとして、先進的なChromium XプラットフォームとGEM-Xテクノロジーを活用し、優れた再現性・感度・効率性を実現します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
最先端のハイスループットシーケンスプラットフォームと専門家のサポートを組み合わせ、シングルセルプロジェクトにおいて競争力のあるコスト効率を維持しながら、卓越したデータ品質を保証します。
シングルセルRNA-Seqは、以下のような幅広い研究分野をサポートする強力なツールです：
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
シングルセルRNA-Seqは、以下のような幅広い研究分野をサポートする強力なツールです：
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
腫瘍微小環境内の細胞の多様性を解明し、がんのメカニズムと潜在的な治療標的を明らかにします。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
免疫細胞の多様性をマッピングし、免疫調節と機能不全の背後にある分子メカニズムを解明します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
発達と制御ネットワークの解読により、神経疾患の潜在的な治療標的を特定します。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
細胞系統と発生軌跡の解明により、器官形成と組織分化を明らかにします。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サービス | サンプルタイプ* | サンプル量 | 輸送条件 |
|---|---|---|---|
| scRNA-seq | Cryopreserved cell suspension | Recommended Amount ≥1,000,000 cells per sample; (minimum ≥ 500,000 cells) | Needs to be shipped with dry ice |
| Fresh cell suspension | Recommended Amount:300,000 cells per sample; (minimum ≥ 100,000 cells) | Needs to be shipped with ice packs within 1hr or harvest |
|
| Frozen tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with dry ice |
|
| Fresh tissue | Tissue weight ≥ 200mg (minimum ≥ 100mg) ≥ 2 tissue pieces/sample, separate 1.5ml cryovials | Needs to be shipped with ice packs within 48hrs of harvest |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq X-Plus Sequencing Platform | |
|---|---|---|
| Read Length | Paired-end 150 bp | |
| Recommended Data | 20,000 – 50,000 read pairs/cell, 100-120Gb/sample | |
| Analysis | Cell Ranger Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.). Alignment of reads to genome. Gene expression quantification. Clustering analysis. Differentially expression analysis between clusters. Visualization. | Standard Analysis Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs. Alignment, UMI counting, Metrics summary. Identification of highly variable gene (HVGs). Cell Subpopulation Identification. Principal component analysis (PCA). Identify clusters of cells. Dimensionality reduction and Visualization. Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters). GO/KEGG/Reactome Enrichment. FunctionalAnnotation of Transcription Factor. Protein-Protein Interaction Network Analysis. |
ノボジーンはエンドツーエンドのサービス群を提供し、お客様が最高品質のデータを得られるようサポートします。これには、実験設計におけるアプリケーション専門家との事前プロジェクト相談、その後のサンプル調製、ライブラリ構築、シーケンス、データQC、バイオインフォマティクス解析が含まれます。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
t-SNE (t-distributed Stochastic Neighbor Embedding)およびUMAP (uniform manifold approximation and projection)による細胞クラスターの可視化。t-SNEと比べて、UMAP可視化ではよりコンパクトな視覚的クラスターが形成され、クラスター間に空きスペースが多くなる傾向があります。
注：各点は1つの細胞を表し、各色はクラスターを指定します。
ヒートマップは、指定された細胞および特徴におけるマーカー遺伝子の発現を示します。この例では、各クラスターの上位10個のマーカー（10個未満の場合は全マーカー）をプロットしています。
注：濃い赤は高い発現レベル、濃い青は低い発現レベルを示します。
バイオリンプロットは、全クラスターにおけるマーカー遺伝子の相対的発現レベルを示します（ここでは6つのマーカー遺伝子のみ表示）。
注：X軸はクラスター、Y軸は発現レベルを表します。
当社のプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
