全長トランスクリプトームシーケンスは、完全で断片化されていないmRNA分子を捕えます。バイオインフォマティクスによる転写産物のアセンブリが不要となるため、新規遺伝子やアイソフォームに関するより包括的かつ正確な解析を実現します。ノボジーンは多様な研究目的に対応する各種全長トランスクリプトームソリューションを提供しています。
全長トランスクリプトームシーケンス（PacBio Iso-Seq）： 選択的スプライシングイベント、融合遺伝子、変動発現アイソフォームを高精度で特徴付ける、費用対効果に優れた柔軟なソリューション。
ナノポアディレクトRNAシーケンス：cDNAへの変換なしに、mRNAを本来の形態のまま直接シーケンスし、塩基修飾（例：m6A、m5C）やポリA末端特性を研究します。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
偏りのない完全なRNAプロファイルを解明し、生物医学、農業、生命科学研究における発見を促進します。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
偏りのない完全なRNAプロファイルを解明し、生物医学、農業、生命科学研究における発見を促進します。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
ノボジーンのプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
全長トランスクリプトームシーケンスは、完全で断片化されていないmRNA分子を捕えます。バイオインフォマティクスによる転写産物のアセンブリが不要となるため、新規遺伝子やアイソフォームに関するより包括的かつ正確な解析を実現します。ノボジーンは多様な研究目的に対応する各種全長トランスクリプトームソリューションを提供しています。
全長トランスクリプトームシーケンス（PacBio Iso-Seq）： 選択的スプライシングイベント、融合遺伝子、変動発現アイソフォームを高精度で特徴付ける、費用対効果に優れた柔軟なソリューション。
ナノポアディレクトRNAシーケンス：cDNAへの変換なしに、mRNAを本来の形態のまま直接シーケンスし、塩基修飾（例：m6A、m5C）やポリA末端特性を研究します。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
各地域に配置されたテクニカルチームによる、個別対応かつ迅速なサービスを提供。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
複雑なサンプルや困難な研究課題に対応した、オーダーメイドのプロジェクト設計と解析。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
300種を超える生物種、5,000超のサンプルから得たデータに裏付けられた、ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスは実証済みの信頼性を提供します。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
ノボジーンのデータは、一貫してメーカーの性能ベンチマークを上回ります。
偏りのない完全なRNAプロファイルを解明し、生物医学、農業、生命科学研究における発見を促進します。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
偏りのない完全なRNAプロファイルを解明し、生物医学、農業、生命科学研究における発見を促進します。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
新規遺伝子、アイソフォーム、遺伝子融合を同定・評価します。選択的スプライシングを包括的にプロファイリングし、潜在的なバイオマーカーを明らかにします。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
全長トランスクリプトと病態を関連付けることで疾患の分子基盤を調査。がんや感染症における薬剤耐性を駆動するトランスクリプトームレベルの変化を解明します。
進化研究および機能研究をサポートする高品質なゲノムアノテーションを実現。
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転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
転写後調節の研究に向け、主要なRNA修飾（例：m6A）の位置特定とポリAテール長測定を実施。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。詳細については、サンプル要件をダウンロードしてご確認ください。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| サンプルタイプ | サービス | サンプル量 (Qubit) | 濃度 | RIN (Agilent 2100) | 純度 (NanoDrop™) |
|---|---|---|---|---|---|
| TotaI RNA | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | ≥ 1.2 μg | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 with flat baseline | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.3-2.5; *NC/QC ≤ 2.0; No genomic contamination |
| TotaI RNA | Nanopore Direct RNA Sequencing | ≥ 5.5 μg | ≧ 375 ng/μL | ≥ 7 (animals, plants, fungi); ≥ 8 (Human) | OD260/280=1.8-2.2; OD260/230=1.6-2.5; *NC/QC ≤ 2; No genomic contamination |
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。カスタマイズされたご要望については、 お問い合わせください 。
| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
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| プラットフォーム | Full-Length Transcriptome Sequencing (PacBio) | Direct RNA (Nanopore) |
|---|---|---|
| Read Length | N50 read length (average) ≥ 1.5 kb | N50 read length (average) ≥ 1 kb |
| Recommended Data Amount | • 5 million HiFi reads for highly expressed genes/isoforms detection • 10 million HiFi reads for moderate/rare genes/isoforms detection | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Data Analysis Capability | • Data QC • Function Annotation With reference genome • Structure analysis • Alternative splicing • Alternative polyadenylation • Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation • Transcription factor analysis • LncRNA prediction • Fusion transcript analysis Without reference genome • Structure analysis • Prediction of coding sequences • Transcription factor analysis • SSR analysis • LncRNA prediction Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads. • Gene/ Transcript expression level analysis • Differentially expressed gene/ transcript analysis (Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) | • Full-length transcripts identification and classification • Transcript structure analysis -Alternative splicing -Novel gene/ Novel transcript prediction and annotation -Transcription factor analysis -LncRNA prediction • Quantification analysis • Differential gene expression analysis • GO/KEGG enrichment analysis of differentially expressed genes • RNA modification analysis • Poly(A) analysis *This service is limited to species with a reference genome. |
ノボジーンの全長トランスクリプトームシーケンスのワークフローは、厳密な段階的プロセスにより高品質な結果を提供します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
円グラフは全長転写産物の分類を示します。
全長転写産物シーケンスデータから得られた選択的スプライシングイベントの概要
ベン図は複数ツールによるノンコーディング転写産物予測を比較し、信頼性の高い下流解析のために選択されたコンセンサスセットを示します。
ボルケーノプロットは変動発現解析の結果を要約し、発現変化が有意な遺伝子を直ちに示します。
棒グラフは、変動発現遺伝子の機能エンリッチメント解析から得られた、最も有意に濃縮されたGene Ontologyタームを表示します。
ノボジーンのプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
