RRBSは、ヒトおよび動物サンプルのCpGアイランドやその他のCpG高密度ゲノム領域に特に焦点を当て、DNAメチル化パターンをプロファイリングするために設計されたターゲットシーケンステクノロジーです。
当社独自のRRBSプロトコルでは、メチル化の影響を受けない制限酵素MspIを使用し、哺乳類ゲノムにおけるDNAメチル化の主要部位であるCpGリッチ領域でDNAを選択的に切断します。これらのCpG高密度領域を濃縮後、得られたDNA断片にバイサルファイト変換を施します。この重要な工程により、非メチル化シトシンはウラシルに脱アミノ化され、メチル化シトシンは化学的に変化しません。続くハイスループットシーケンスとレファレンスゲノムへのアラインメントにより、シトシンのメチル化状態を一塩基解像度で正確に決定できます。
DNAメチル化解析の費用対効率に優れたソリューションであるRRBSは、生物学的に重要な領域(例:CpGアイランド)のみにターゲットを絞ることで、必要なシーケンスデータ量を大幅に削減し、大規模コホート研究に適しています。CpGおよび非CpGメチル化コンテキストを含む全ゲノムの包括的なメチル化プロファイリングについては、全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)サービスをご参照ください。


