従来、シングルセルシーケンスでは主にショートリードシーケンスが用いられており、シングルセル遺伝子発現に関する知見を効果的に提供する一方で、選択的スプライシング、スプライシング制御、トランスクリプトームの複雑性、アイソフォーム多様性に関する情報の取得には限界があります。
シングルセルアッセイにロングリードシーケンスを導入することで、従来のショートリードシーケンス手法に見られたこの不足を補います。この統合により分子メカニズムに関する知見が得られ、複雑な構造変異の同定、全トランスクリプトームにおける選択的スプライシングイベントの包括的解析、シングルセルレベルでの細胞種特異的mRNAアイソフォーム発現の探索が可能になります。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
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核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
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GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
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ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
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最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
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WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
遺伝性疾患、がん、集団研究に関するヒト遺伝学の包括的な知見を引き出します。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
遺伝性疾患、がん、集団研究に関するヒト遺伝学の包括的な知見を引き出します。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
当社のプラットフォームは、
プロジェクト設計からデータ納品まで、お客様固有の実験ニーズに合わせたソリューションを提供し、シームレスな体験を実現します。
従来、シングルセルシーケンスでは主にショートリードシーケンスが用いられており、シングルセル遺伝子発現に関する知見を効果的に提供する一方で、選択的スプライシング、スプライシング制御、トランスクリプトームの複雑性、アイソフォーム多様性に関する情報の取得には限界があります。
シングルセルアッセイにロングリードシーケンスを導入することで、従来のショートリードシーケンス手法に見られたこの不足を補います。この統合により分子メカニズムに関する知見が得られ、複雑な構造変異の同定、全トランスクリプトームにおける選択的スプライシングイベントの包括的解析、シングルセルレベルでの細胞種特異的mRNAアイソフォーム発現の探索が可能になります。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
200件を超えるシングルセル・ロングリードRNA-seqプロジェクトを、短納期かつ信頼性の高い結果で提供してきました。
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
核抽出や凍結組織サンプル向けに最適化したパイプラインを含む柔軟なワークフロー
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
GEM-X搭載10x Chromium Xに加え、ショートリード・ロングリードシーケンス向けのIlluminaおよびNanoporeプラットフォーム。
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
ハイスループットプラットフォーム、専門的サポート、高品質データを組み合わせた、費用対効果の高いロングリード・シングルセルソリューション
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
最短2週間で高品質なシーケンスデータを納品し、お客様のプロジェクトを効率的に進めます。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
WES、トランスクリプトーム、エピゲノムプラットフォームとシームレスに統合し、より深い生物学的・機能的知見を提供します。
遺伝性疾患、がん、集団研究に関するヒト遺伝学の包括的な知見を引き出します。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
遺伝性疾患、がん、集団研究に関するヒト遺伝学の包括的な知見を引き出します。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
完全長スプライスバリアントを明確に同定・定量します。これは、脳やがんなどの複雑な組織における機能的多様性の理解に重要です。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
ロングリードは融合ブレークポイント全体にまたがるため、単一がん細胞における複雑ながん原性遺伝子融合を正確に検出できます。
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
サンプル量は参考値です。以下をダウンロードしてご確認ください。サンプル要件 詳細については、以下をダウンロードしてご確認ください。 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
お客様に最良の品質のデータを提供するため、エンドツーエンドのサービスをサポートします。実験計画に関するアプリケーションスペシャリストとのプロジェクト前相談、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス、データ品質保証、バイオインフォマティクス解析を含みます。
表示されている推奨データ量および解析内容は参考値です。詳細については、 お問い合わせください カスタマイズされたご要望については。
| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| サンプルタイプ | サンプル量 |
|---|---|
| Single cell suspension | ≥ 1,000,000 cells |
| cDNA from 10x Genomics | ≥ 50 ng |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
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| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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| シーケンスプラットフォーム | Illumina NovaSeq System | Nanopore PromethION |
|---|---|---|
| Read length | Paired-end 150bp | Median read length: ~700-1000bp |
| Recommended Data Output | 50,000 pair reads/cell 100-120Gb | 1 PromethION Flow Cell ~100 M total reads/cell |
| Data QC Analysis | Cell Ranger Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.) Alignment of reads to genome Gene expression quantification Clustering analysis Differentially expression analysis between clusters Visualization | Wf-single-cell Data QC Identify the cell barcode and UMI sequences present in Nanopore sequencing reads Summary metrics (read quality, number of cells, genes and transcripts identified within each sample, median genes per cell, and sequence saturation) UMAP projections |
| Standard Analysis | Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs Alignment, UMI counting, Metrics summary Identification of highly variable gene (HVGs) Cell Subpopulation Identification Principal component analysis (PCA) Identify clusters of cells Dimensionality reduction and Visualization Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters) GO/KEGG/Reactome Enrichment Functional Annotation of Transcription Factor Protein-Protein Interaction Network Analysis | Data QC Mapping and Quantification Seurat analysis: Dimensionality reduction, clustering, and differential analysis Base on gene Base on transcripts (isoform) GO/KEGG/Reactome Enrichment Analysis Alternative Splicing Fushion Gene Detection |
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S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
S100A4遺伝子の発現レベルは細胞種特異性を示しませんが、そのアイソフォームは異なる細胞集団間で変動発現を示します。
SDC4:SH3PXD2B融合遺伝子は、ロングリードシーケンスの結果でのみ同定できます。
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